少林禅武医文化是嵩山文化的重要组成部分，禅医文化是少林文化的精髓。禅武医三者相辅 相成，武因禅而生，医因武而来，武、医又终归入禅。少林寺创建后，为了同疾病作斗争，为了 解决练武时的跌打损伤，寺僧们在学禅习武的间隙，充分利用少林地处嵩山的优势，利用嵩山有 丰富的药材资源的优势，经过无数次有意识的试用和观察，不断积累了丰富的用药经验，逐渐形 成了许多医疗秘方。寺僧们练武的同时，发现他们健身强体少林八段锦、易筋经等本身是一种特 殊的气功，具有健体和医疗的双重作用，于是他们就又逐步推演出了气功疗法、推拿疗法和点穴 疗法。后来，经过寺僧们的不断实践，再加之佛教本身普度众生的济世活人思想，少林医学由外 科而内科，由治疗跌打损伤而治疗百病，于是逐渐形成了独具特色的少林医学。
少林医学的探源，至少要追溯到建寺之初。据《少林武僧志》记载，僧稠禅师曾取嵩参熬汤 为跋陀补养身体。跋陀的另一高足慧光也曾以铁针为一昏迷之人疗伤。禅宗二祖慧可断臂求法后 在钵盂峰上养伤，寺僧们采来草药为之医治。以后少林寺涌现了大批知名僧医，北魏后期的少林 高僧洪遵和志刚被尊为活菩萨，分别撰有《少林寺针灸秘抄》和《少林僧医宝囊》。隋代少林僧 人子升善武好医，尤其对气功和点穴治病深有研究，晚年撰述的《摩穴秘旨》主要阐述了气功医 治和点穴治疗的内容，特别详细介绍了人身常用的六十八穴的部位、取法、疗效及配方，还列举 了 100多种常见病的点穴治疗指要。十三棍僧救唐王中的寺主僧志操也是一位著名的僧医，入寺 前曾习医十年，治疗跌打损伤，总是先用针灸，少数不愈者，才用嵩山上的草药制成的丸、丹、 膏等，并著有《少室僧针灸秘经集》和《跌打秘囊》等。
唐朝末年的福湖和尚也是医技高明，善用针灸和草药，每遇患者，扎针不过二，用药不过三, 特别对止血、内瘀、厥症、危症等的治疗有独绝之处，撰有《少林伤科十大方》。五代十国时期, 著名僧医有福居、智广，精于伤科，尤熟诸人体经脉，善点穴治病。凡筋脉拘挛，跌跛之类，损伤 之类，皆以竹片为杖，指其痛处或兼施药液外涂，丸散内服，常获立愈之效。宋代的洪温禅师擅长 骨伤科，多以针刺加火罐解除患者痛苦，撰有《针后拔罐秘法》，临终前将技艺传授给觉远和尚。 觉远和尚对内科深有研究，有《少林寺内科神效录》传世。宋代少林伤科在金疮方面得到进一步发 展，不少僧医擅长伤科，并有著述。如文宥精于医，擅望诊，“隔垣而知之”，观面色洞知病之所 在，著有《必效方》3卷。据《百一方》记载，壕梁录泉寺有僧传治打扑伤损方。南宋医家稽幼 域，师少林武、医，后护驾到浙江绍安，悬壶为医，传艺授徒，创“山阴下方寺院西房伤科”，著 《秘传伤科》，为寺中传钵，成了浙江著名的伤科世家。可见少林医学已传于民间，并在民间繁衍。
金朝末年，东林志隆出任少林寺住持，他创建了少林药局，为僧俗治病，著名文学家元好问 亲撰《少林药局记》。元代的惠定被尊为少林神医，著有《少林骨科旨要》《少林医家丸散药 谱》，惠矩在《针刺九十神穴》中总结了元以前僧医大师的经验，是针灸用穴的临床精华。明代 时少林寺还设医座、药局司等医僧官，同时还开设寺医学堂，著名僧医有本明、幻休、正道等。 明末倭寇侵扰海疆，少林月空和尚率僧兵赴东南抗倭，自备军中急救良药，如少林行军散、八珍 丹。少林出名僧医有智正、智谆。智正收集明以前寺院有效秘方，编著了《少林寺秘方》，墨本 秘不外传。明嘉靖二年，升远真人经过多年的民间搜集整理出《跌损妙方》一书，少林伤科的真 传秘方为世人所知，填补了跌打损伤在伤科学上的空白，也为后世损伤诊治的发展奠定了基础。 异远真人成为少林伤科之始祖，其后众多伤科学家皆宗其说，从而形成少林伤科学派，是中国骨 伤最有特色的流派之一。
明末清初，伤科秘方著述传抄甚多，其法多宗少林伤科，岀名僧医有字宽、湛举、湛化、南 洲、本园、也然、毛公、太双、梅亭等。湛举、湛化两位僧医进一步补充、完善整理少林寺伤科 秘方为《少林跌打损伤秘方》，制成木刻版，藏于法堂，但后被焚。清末以后，知名僧医有淳 济、寂勤、贞绪、恒林、妙月。民国年间，卢俊擅武精医，著《少林秘真球囊》，民间有《少林 寺12时辰12穴秘方》《少林寺军阵伤科秘传》等流传。少林医学秘方不断传入寺外，惠及大众, 清朝时，登封人景日昣曾拜少林僧人为师，刻苦学习医学知识，据说曾因治好皇太后的病而声名 远扬。退归故里后，景日昣结合自己的实践，编著了医书《嵩崖尊僧》，后改为《嵩崖尊生》，至 今仍是中医的圭臬。《嵩崖尊生》中的秘方有些就直接来源于少林。近代，少林寺名誉方丈德禅 也是一代名医，在传承少林医学文化方面功德无量，生前曾在登封县中医院坐堂行医，其高超的 医术为人们所称道，曾将《少林损伤急救秘穴秘法》整理成章，刊载于《武林》杂志。20世纪80 年代，德虔先后整理、编著《少林寺秘方集锦》《少林寺伤科秘方》《少林点穴法》等书，将少林 秘藏公布于世，惠国利民。现代著名禅医德建还把师父留下的一些独创少林秘方送往国际卫生组 织检查并通过，目前正在进行临床实验。严世芸主编、上海中医学院出版社出版的《中国医籍通 考》曾载有《少林寺秘方集锦》《少林真传伤科秘方》等。多年来，少林寺组织僧医和中医药方面 的专家进行了一系列的整理和挖掘，2000年4月，《少林武功医宗秘笈》珍藏本历时3年终于问 世，其中包涵了少林寺二十九代方丈行正大和尚临终前流传下的少林医宗秘方。该书已被国家历 史博物馆、国家图书馆、瑞典国王作永久收藏。2004年,重新恢复少林药局。近年来，还不断有人 献出秘方，汇总后现刻于法王寺的石碑上。
少林医学注重理论与实践的结合，是在对人体、自然、心理等长期思索和实践中，在对前人 经验的不断总结和完善中形成的完整系统的医疗体系，不仅重视伤后的治疗，也强调练功前的保 护，不仅重视治疗，也重视疾病的预防。少林医学强调辩证施治，以阴阳变化的相互关系来分析 人之生理、病理现象，认为人体上下、内外之各部位之间以及内脏与外界环境之间皆为阴阳的对 立统一，断定疾病的产生，皆为阴阳失调的结果，通过望问切，观察阴阳的变化，来对症治疗。 少林医学还注重整体治疗，把人与自然、人体内部各器官视为一个有机的整体，注意调整整体机 能，达到治病救人的效果。少林伤科的基础理论有解剖学说、气血学说、经络学说、脏象学说、 阴阳五行学说、子午流注、易理学说等。解剖学说是医学的基础理论，同时也是少林功夫——卸 骨术、擒拿术的基础理论。同样正骨术也要对上述筋骨了如指掌。
“少林绝技终大用，无僧不医有令名。气功摩穴皆入道，济世活民即传灯”，少林以医学解除 人们身体方面的痛苦，和禅学解脱人们心灵痛苦一样，显示了普度众生的宗教功能，以其独特理 论体系和应用方式在祖国医学史上占据了一席之地，使少林于禅武之外，给人们又提供了一个了 解嵩山、了解少林的重要途径。